Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Nkx6-3Q3UHX8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nkx6-3Q3UHX8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nkx6-3Q3UHX8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Nkx6-3Q3UHX8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Nkx6-3Q3UHX8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Nkx6-3Q3UHX8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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