Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sdr16c6Q05A13 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sdr16c6Q05A13 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms