Protein–RNA interactions for Protein: P09793

Ctla4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla4P09793 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctla4P09793 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctla4P09793 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctla4P09793 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctla4P09793 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctla4P09793 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctla4P09793 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctla4P09793 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctla4P09793 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla4P09793 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms