Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Speer4aF8VPX6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Speer4aF8VPX6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4aF8VPX6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms