Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brpf1B2RRD7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brpf1B2RRD7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brpf1B2RRD7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms