Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hacd4A2AKM2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd4A2AKM2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms