Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpv2Q9WTR1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpv2Q9WTR1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms