Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng3Q9JJV5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng3Q9JJV5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms