Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc46a3Q9DC26 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc46a3Q9DC26 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms