Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SrmsQ62270 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrmsQ62270 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrmsQ62270 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms