Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme1P97371 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme1P97371 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms