Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2mP61082 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2mP61082 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2mP61082 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2mP61082 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2mP61082 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2mP61082 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2mP61082 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2mP61082 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2mP61082 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2mP61082 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2mP61082 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2mP61082 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2mP61082 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2mP61082 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms