Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabep1O35551 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabep1O35551 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms