Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
6030445D17RikE9Q8F9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms