Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700019A02RikA0A087WPV9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms