Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Cldn19Q9ET38 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Cldn19Q9ET38 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Cldn19Q9ET38 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Cldn19Q9ET38 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Cldn19Q9ET38 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Cldn19Q9ET38 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Cldn19Q9ET38 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Cldn19Q9ET38 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Cldn19Q9ET38 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Cldn19Q9ET38 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Cldn19Q9ET38 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn19Q9ET38 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.7 ms