Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a4bQ9ES61 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4bQ9ES61 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms