Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx6Q9ER75 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms