Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Ssxb10Q6XAR7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ssxb10Q6XAR7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ssxb10Q6XAR7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ssxb10Q6XAR7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ssxb10Q6XAR7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ssxb10Q6XAR7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ssxb10Q6XAR7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ssxb10Q6XAR7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssxb10Q6XAR7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssxb10Q6XAR7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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