Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MitfQ08874 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms