Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Xrn1P97789 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Xrn1P97789 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrn1P97789 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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