Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5538W4VSP6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5538W4VSP6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5538W4VSP6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5538W4VSP6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5538W4VSP6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5538W4VSP6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5538W4VSP6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm5538W4VSP6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5538W4VSP6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5538W4VSP6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5538W4VSP6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5538W4VSP6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5538W4VSP6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5538W4VSP6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5538W4VSP6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5538W4VSP6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5538W4VSP6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5538W4VSP6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm5538W4VSP6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5538W4VSP6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms