Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN9

Rhox2d, MCG125586, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2dW4VSN9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox2dW4VSN9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox2dW4VSN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox2dW4VSN9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox2dW4VSN9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox2dW4VSN9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox2dW4VSN9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox2dW4VSN9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox2dW4VSN9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox2dW4VSN9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox2dW4VSN9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox2dW4VSN9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox2dW4VSN9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox2dW4VSN9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox2dW4VSN9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox2dW4VSN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox2dW4VSN9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox2dW4VSN9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox2dW4VSN9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox2dW4VSN9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox2dW4VSN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox2dW4VSN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox2dW4VSN9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhox2dW4VSN9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox2dW4VSN9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox2dW4VSN9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox2dW4VSN9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox2dW4VSN9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms