Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2X1

Hnrnpf, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpfQ9Z2X1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HnrnpfQ9Z2X1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HnrnpfQ9Z2X1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HnrnpfQ9Z2X1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HnrnpfQ9Z2X1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HnrnpfQ9Z2X1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpfQ9Z2X1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpfQ9Z2X1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HnrnpfQ9Z2X1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms