Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CcniQ9Z2V9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CcniQ9Z2V9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CcniQ9Z2V9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CcniQ9Z2V9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CcniQ9Z2V9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CcniQ9Z2V9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms