Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Knop1Q9Z2Q2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Knop1Q9Z2Q2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Knop1Q9Z2Q2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Knop1Q9Z2Q2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Knop1Q9Z2Q2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Knop1Q9Z2Q2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Knop1Q9Z2Q2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Knop1Q9Z2Q2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Knop1Q9Z2Q2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Knop1Q9Z2Q2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Knop1Q9Z2Q2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Knop1Q9Z2Q2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Knop1Q9Z2Q2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Knop1Q9Z2Q2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Knop1Q9Z2Q2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Knop1Q9Z2Q2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Knop1Q9Z2Q2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Knop1Q9Z2Q2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Knop1Q9Z2Q2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Knop1Q9Z2Q2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Knop1Q9Z2Q2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Knop1Q9Z2Q2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Knop1Q9Z2Q2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Knop1Q9Z2Q2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Knop1Q9Z2Q2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Knop1Q9Z2Q2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Knop1Q9Z2Q2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Knop1Q9Z2Q2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Knop1Q9Z2Q2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Knop1Q9Z2Q2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Knop1Q9Z2Q2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Knop1Q9Z2Q2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms