Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd4Q9Z2D7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mbd4Q9Z2D7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mbd4Q9Z2D7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mbd4Q9Z2D7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd4Q9Z2D7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd4Q9Z2D7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd4Q9Z2D7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd4Q9Z2D7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd4Q9Z2D7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd4Q9Z2D7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd4Q9Z2D7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd4Q9Z2D7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd4Q9Z2D7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms