Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbiaQ9Z1E3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfkbiaQ9Z1E3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbiaQ9Z1E3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbiaQ9Z1E3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbiaQ9Z1E3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms