Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp2Q9Z0E6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp2Q9Z0E6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gbp2Q9Z0E6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gbp2Q9Z0E6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp2Q9Z0E6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms