Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV56

Gdf2, Growth/differentiation factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf2Q9WV56 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf2Q9WV56 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf2Q9WV56 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf2Q9WV56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdf2Q9WV56 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdf2Q9WV56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdf2Q9WV56 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf2Q9WV56 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdf2Q9WV56 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf2Q9WV56 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdf2Q9WV56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdf2Q9WV56 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gdf2Q9WV56 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdf2Q9WV56 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdf2Q9WV56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdf2Q9WV56 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf2Q9WV56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf2Q9WV56 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf2Q9WV56 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf2Q9WV56 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms