Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FarsbQ9WUA2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FarsbQ9WUA2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FarsbQ9WUA2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FarsbQ9WUA2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FarsbQ9WUA2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FarsbQ9WUA2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FarsbQ9WUA2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FarsbQ9WUA2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FarsbQ9WUA2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FarsbQ9WUA2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FarsbQ9WUA2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FarsbQ9WUA2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FarsbQ9WUA2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FarsbQ9WUA2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FarsbQ9WUA2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FarsbQ9WUA2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FarsbQ9WUA2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms