Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scnn1bQ9WU38 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scnn1bQ9WU38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Scnn1bQ9WU38 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scnn1bQ9WU38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scnn1bQ9WU38 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scnn1bQ9WU38 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scnn1bQ9WU38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scnn1bQ9WU38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scnn1bQ9WU38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scnn1bQ9WU38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scnn1bQ9WU38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scnn1bQ9WU38 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scnn1bQ9WU38 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scnn1bQ9WU38 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scnn1bQ9WU38 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scnn1bQ9WU38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scnn1bQ9WU38 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scnn1bQ9WU38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scnn1bQ9WU38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scnn1bQ9WU38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scnn1bQ9WU38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scnn1bQ9WU38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scnn1bQ9WU38 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scnn1bQ9WU38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scnn1bQ9WU38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scnn1bQ9WU38 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scnn1bQ9WU38 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scnn1bQ9WU38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scnn1bQ9WU38 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scnn1bQ9WU38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scnn1bQ9WU38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms