Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skp1Q9WTX5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skp1Q9WTX5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skp1Q9WTX5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skp1Q9WTX5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Skp1Q9WTX5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Skp1Q9WTX5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skp1Q9WTX5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skp1Q9WTX5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skp1Q9WTX5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skp1Q9WTX5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skp1Q9WTX5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skp1Q9WTX5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skp1Q9WTX5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skp1Q9WTX5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Skp1Q9WTX5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skp1Q9WTX5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skp1Q9WTX5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Skp1Q9WTX5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms