Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nfe2l3Q9WTM4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nfe2l3Q9WTM4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nfe2l3Q9WTM4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nfe2l3Q9WTM4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nfe2l3Q9WTM4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Nfe2l3Q9WTM4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nfe2l3Q9WTM4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Nfe2l3Q9WTM4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nfe2l3Q9WTM4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nfe2l3Q9WTM4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nfe2l3Q9WTM4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nfe2l3Q9WTM4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Nfe2l3Q9WTM4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Nfe2l3Q9WTM4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nfe2l3Q9WTM4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nfe2l3Q9WTM4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nfe2l3Q9WTM4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nfe2l3Q9WTM4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nfe2l3Q9WTM4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nfe2l3Q9WTM4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nfe2l3Q9WTM4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nfe2l3Q9WTM4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nfe2l3Q9WTM4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nfe2l3Q9WTM4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms