Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1X5

Abcc5, Multidrug resistance-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc5Q9R1X5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc5Q9R1X5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Abcc5Q9R1X5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Abcc5Q9R1X5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc5Q9R1X5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abcc5Q9R1X5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abcc5Q9R1X5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Abcc5Q9R1X5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Abcc5Q9R1X5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Abcc5Q9R1X5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Abcc5Q9R1X5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Abcc5Q9R1X5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Abcc5Q9R1X5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Abcc5Q9R1X5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Abcc5Q9R1X5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Abcc5Q9R1X5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Abcc5Q9R1X5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Abcc5Q9R1X5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Abcc5Q9R1X5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Abcc5Q9R1X5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abcc5Q9R1X5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abcc5Q9R1X5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abcc5Q9R1X5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Abcc5Q9R1X5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abcc5Q9R1X5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abcc5Q9R1X5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Abcc5Q9R1X5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Abcc5Q9R1X5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Abcc5Q9R1X5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Abcc5Q9R1X5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Abcc5Q9R1X5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Abcc5Q9R1X5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Abcc5Q9R1X5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Abcc5Q9R1X5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Abcc5Q9R1X5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Abcc5Q9R1X5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Abcc5Q9R1X5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Abcc5Q9R1X5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abcc5Q9R1X5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abcc5Q9R1X5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abcc5Q9R1X5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc5Q9R1X5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc5Q9R1X5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc5Q9R1X5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc5Q9R1X5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc5Q9R1X5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abcc5Q9R1X5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc5Q9R1X5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc5Q9R1X5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc5Q9R1X5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc5Q9R1X5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc5Q9R1X5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc5Q9R1X5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc5Q9R1X5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc5Q9R1X5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc5Q9R1X5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc5Q9R1X5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc5Q9R1X5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc5Q9R1X5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc5Q9R1X5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc5Q9R1X5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc5Q9R1X5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc5Q9R1X5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms