Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod2Q9R0B9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plod2Q9R0B9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plod2Q9R0B9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plod2Q9R0B9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Plod2Q9R0B9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms