Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tk2Q9R088 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tk2Q9R088 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tk2Q9R088 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tk2Q9R088 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tk2Q9R088 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tk2Q9R088 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tk2Q9R088 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms