Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc1Q9QZF2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpc1Q9QZF2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc1Q9QZF2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gpc1Q9QZF2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc1Q9QZF2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc1Q9QZF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms