Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZA0

Ca5b, Carbonic anhydrase 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca5bQ9QZA0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca5bQ9QZA0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca5bQ9QZA0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca5bQ9QZA0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ca5bQ9QZA0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca5bQ9QZA0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca5bQ9QZA0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca5bQ9QZA0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca5bQ9QZA0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ca5bQ9QZA0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ca5bQ9QZA0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ca5bQ9QZA0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ca5bQ9QZA0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ca5bQ9QZA0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ca5bQ9QZA0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ca5bQ9QZA0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms