Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PnckQ9QYK9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PnckQ9QYK9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PnckQ9QYK9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PnckQ9QYK9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PnckQ9QYK9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PnckQ9QYK9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms