Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdh11Q9QYF1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rdh11Q9QYF1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdh11Q9QYF1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh11Q9QYF1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh11Q9QYF1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh11Q9QYF1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rdh11Q9QYF1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh11Q9QYF1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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