Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tomm40Q9QYA2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tomm40Q9QYA2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tomm40Q9QYA2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tomm40Q9QYA2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms