Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ehd3Q9QXY6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ehd3Q9QXY6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ehd3Q9QXY6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ehd3Q9QXY6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ehd3Q9QXY6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms