Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Jag1Q9QXX0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Jag1Q9QXX0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Jag1Q9QXX0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Jag1Q9QXX0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Jag1Q9QXX0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Jag1Q9QXX0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Jag1Q9QXX0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Jag1Q9QXX0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Jag1Q9QXX0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Jag1Q9QXX0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Jag1Q9QXX0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Jag1Q9QXX0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Jag1Q9QXX0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Jag1Q9QXX0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Jag1Q9QXX0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Jag1Q9QXX0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Jag1Q9QXX0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Jag1Q9QXX0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Jag1Q9QXX0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Jag1Q9QXX0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Jag1Q9QXX0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Jag1Q9QXX0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Jag1Q9QXX0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Jag1Q9QXX0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Jag1Q9QXX0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Jag1Q9QXX0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Jag1Q9QXX0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Jag1Q9QXX0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Jag1Q9QXX0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Jag1Q9QXX0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Jag1Q9QXX0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Jag1Q9QXX0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Jag1Q9QXX0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Jag1Q9QXX0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Jag1Q9QXX0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms