Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChmQ9QXG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ChmQ9QXG2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ChmQ9QXG2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ChmQ9QXG2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChmQ9QXG2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ChmQ9QXG2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ChmQ9QXG2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ChmQ9QXG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ChmQ9QXG2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ChmQ9QXG2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ChmQ9QXG2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ChmQ9QXG2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ChmQ9QXG2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ChmQ9QXG2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ChmQ9QXG2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ChmQ9QXG2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ChmQ9QXG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ChmQ9QXG2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ChmQ9QXG2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChmQ9QXG2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChmQ9QXG2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ChmQ9QXG2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ChmQ9QXG2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ChmQ9QXG2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChmQ9QXG2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms