Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prg4Q9JM99 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prg4Q9JM99 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prg4Q9JM99 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prg4Q9JM99 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prg4Q9JM99 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prg4Q9JM99 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms