Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PnkpQ9JLV6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PnkpQ9JLV6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PnkpQ9JLV6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PnkpQ9JLV6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PnkpQ9JLV6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PnkpQ9JLV6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PnkpQ9JLV6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PnkpQ9JLV6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PnkpQ9JLV6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PnkpQ9JLV6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PnkpQ9JLV6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PnkpQ9JLV6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PnkpQ9JLV6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PnkpQ9JLV6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms