Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Extl1Q9JKV7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Extl1Q9JKV7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Extl1Q9JKV7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Extl1Q9JKV7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Extl1Q9JKV7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Extl1Q9JKV7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Extl1Q9JKV7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Extl1Q9JKV7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Extl1Q9JKV7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Extl1Q9JKV7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Extl1Q9JKV7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Extl1Q9JKV7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Extl1Q9JKV7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Extl1Q9JKV7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Extl1Q9JKV7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Extl1Q9JKV7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Extl1Q9JKV7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Extl1Q9JKV7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms