Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trem1Q9JKE2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trem1Q9JKE2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trem1Q9JKE2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trem1Q9JKE2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trem1Q9JKE2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trem1Q9JKE2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trem1Q9JKE2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trem1Q9JKE2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trem1Q9JKE2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trem1Q9JKE2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trem1Q9JKE2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trem1Q9JKE2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trem1Q9JKE2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trem1Q9JKE2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trem1Q9JKE2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms