Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnip1Q9JJ57 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kcnip1Q9JJ57 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnip1Q9JJ57 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnip1Q9JJ57 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnip1Q9JJ57 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnip1Q9JJ57 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnip1Q9JJ57 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnip1Q9JJ57 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnip1Q9JJ57 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnip1Q9JJ57 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kcnip1Q9JJ57 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Kcnip1Q9JJ57 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnip1Q9JJ57 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms